Scooby-Doo! The Mystery Begins on vuonna 2009 ensi-iltansa saanut fantasiaseikkailu. Elokuva on kolmas elävillä näyttelijöillä toteutettu Scooby-Doo-elokuva, vaikkakin sen tapahtumat sijoittuvat sarjan alkuun. Elokuvassa näytetään, kuinka mysteeripoppoo sai alkunsa.
Elokuvalle tehtiin jatko-osa vuonna 2010, Scooby-Doo! Curse of the Lake Monster.