Batman: Salaperäinen Batwoman (Batman: Mystery of the Batwoman) on vuonna 2003 suoraan DVD:lle julkaistu animaatioelokuva, jonka ohjasi Curt Geda ja käsikirjoitti Alan Burnett. Pääosassa ääninäyttelijävät muun muassa Kevin Conroy, Kimberly Brooks ja Hector Elizondo.
Elokuva sijoittuu samaan DC-animaatiouniversumiin, kuin The New Batman Adventures.